Клинические проявления МДС носят неспецифический характер, т.е. не являются характерными только для этого заболевания. Это связано с тем, что жалобы пациентов с МДС обусловлены цитопенией и степенью снижения показателей крови и, следовательно, могут встречаться при любом болезненном состоянии, сопровождающимся анемией, лейкопенией и/или тромбоцитопенией.

Неспецифичность жалоб нередко является причиной позднего обращения пациента к врачу, т.к. расцениваются как проявление перенапряжения на работе, хронического недосыпания или возраста. В свою очередь, отсутствие настороженности врача нередко приводит к длительному и необоснованному назначению витаминов или препаратов железа.

Характер и интенсивность жалоб в немалой степени зависят от возраста, физической активности, наличия сопутствующих заболеваний.

При анемии пациенты жалуются на слабость, повышенную  утомляемость, одышку при физической нагрузке, учащенное сердцебиение, усиление или появление приступов стенокардии. Кожные и слизистые оболочки нередко становятся бледными.

 Лейкопения может сопровождаться частыми простудными и инфекционными заболеваниями.  

При снижении уровня тромбоцитов отмечается появление «синяков» на коже и слизистых оболочках, возникающих спонтанно или при физическом воздействии. Возможны десневые, носовые и другие виды кровотечений.